Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1Q9NZ71 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1Q9NZ71 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms