Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9orf78Q9NZ63 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9orf78Q9NZ63 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9orf78Q9NZ63 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9orf78Q9NZ63 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C9orf78Q9NZ63 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms