Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms