Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM53CQ9NYF3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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FAM53CQ9NYF3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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FAM53CQ9NYF3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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FAM53CQ9NYF3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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FAM53CQ9NYF3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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FAM53CQ9NYF3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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FAM53CQ9NYF3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
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FAM53CQ9NYF3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM53CQ9NYF3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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FAM53CQ9NYF3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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FAM53CQ9NYF3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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FAM53CQ9NYF3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM53CQ9NYF3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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