Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GDAP2Q9NXN4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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