Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms