Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZCCHC3Q9NUD5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZCCHC3Q9NUD5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms