Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJB4Q9NTQ9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms