Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms