Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms