Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNBIP1Q9NSA3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms