Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HELLSQ9NRZ9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms