Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SERINC1Q9NRX5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms