Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX15Q9NRS6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms