Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTL1Q9NRR1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms