Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2B1Q9NRF2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH2B1Q9NRF2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms