Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms