Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NRIP3Q9NQ35 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NRIP3Q9NQ35 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms