Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLCO1B3Q9NPD5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLCO1B3Q9NPD5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLCO1B3Q9NPD5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLCO1B3Q9NPD5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLCO1B3Q9NPD5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLCO1B3Q9NPD5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SLCO1B3Q9NPD5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLCO1B3Q9NPD5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLCO1B3Q9NPD5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms