Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CYP4F12Q9HCS2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CYP4F12Q9HCS2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms