Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8X3

LINC00574, Putative uncharacterized protein LINC00574, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00574Q9H8X3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00574Q9H8X3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms