Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF41Q9H4P4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms