Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBPF3Q9H094 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms