Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EDEM3Q9BZQ6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EDEM3Q9BZQ6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms