Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms