Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPCDR1Q9BY65 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms