Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUSC1Q9BVN2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUSC1Q9BVN2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms