Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KATNB1Q9BVA0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms