Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCMBPQ9BTE3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms