Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RIOK1Q9BRS2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIOK1Q9BRS2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms