Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MESP1Q9BRJ9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MESP1Q9BRJ9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms