Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TXNDC17Q9BRA2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TXNDC17Q9BRA2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TXNDC17Q9BRA2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TXNDC17Q9BRA2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TXNDC17Q9BRA2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TXNDC17Q9BRA2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TXNDC17Q9BRA2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TXNDC17Q9BRA2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TXNDC17Q9BRA2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TXNDC17Q9BRA2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TXNDC17Q9BRA2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TXNDC17Q9BRA2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TXNDC17Q9BRA2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TXNDC17Q9BRA2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TXNDC17Q9BRA2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TXNDC17Q9BRA2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TXNDC17Q9BRA2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms