Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQB6

VKORC1, Vitamin K epoxide reductase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VKORC1Q9BQB6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VKORC1Q9BQB6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VKORC1Q9BQB6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms