Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CITED1Q99966 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CITED1Q99966 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms