Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN18Q99952 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN18Q99952 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms