Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5SQ99766 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5SQ99766 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms