Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POP1Q99575 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POP1Q99575 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POP1Q99575 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POP1Q99575 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POP1Q99575 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POP1Q99575 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POP1Q99575 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POP1Q99575 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POP1Q99575 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POP1Q99575 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POP1Q99575 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms