Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EYA3Q99504 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms