Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms