Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMG1Q96Q15 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMG1Q96Q15 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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