Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SORCS2Q96PQ0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms