Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD27Q96NW4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms