Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCZQ96LD1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGCZQ96LD1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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