Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00208Q96KT6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms