Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VCPIP1Q96JH7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms