Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN37Q96GY3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN37Q96GY3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms