Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BCANQ96GW7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BCANQ96GW7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms