Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCMH1Q96GD3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SCMH1Q96GD3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms