Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL1Q96FI4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms