Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSUN4Q96CB9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSUN4Q96CB9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms